Johannes Dijkstra (1957) kreeg zijn eerste orgellessen van Wim de Ruiter. Hij voltooide zijn studie in Leeuwarden bij Jan Jongepier in 1979. Nadat hij vanuit Friesland in Zwolle terecht was gekomen studeerde hij clavecimbel bij Chris Farr en later nog kerkmuziek bij Harm Jansen. Beide studies aan het Conservatorium te Zwolle.
In het dagelijks leven is hij als docent verbonden aan de muziekschool te Meppel. Hij is organist bij de Doopsgezinde Gemeente Zwolle en tevens is hij organist van de dorpskerk te Wijhe.